ในการแข่งขันมักมีธงสีต่างๆ ใช้แทนความหมายที่ไม่เหมือนกัน แต่จะมีธงชนิดหนึ่งที่ใช้กันอย่างแพร่หลาย คือธงตราหมากรุกที่ใช้โบกสะบัดเมื่อเข้าเส้นชัย
ลักษณะของธงตราหมากรุกจะเป็นตารางสีขาวสลับดำ โดยที่มาของธงไม่ได้มีบันทึกไว้เป็นหลักฐานอย่างแน่ชัด แต่ได้มีภาพถ่ายที่เก่าแก่อยู่ภาพหนึ่งเป็นการใช้ธงตราหมากรุกสำหรับการเข้าเส้นชัยการแข่งขันรถยนต์ชิงถ้วย Vanderblit Cup เมื่อปี 1904 โดยจัดขึ้นที่ ลองไอส์แลนด์ รัฐนิวยอร์ก ประเทศสหรัฐอเมริกา แต่หลักฐานดังกล่าวก็ไม่แน่ชัด เพราะมีนักประวัติศาสตร์ได้ให้ข้อมูลแย้งว่าภาพที่ปรากฎน่าจะอยู่ในช่วงปี 1906-1908
โดยมีสมมุติฐานหนึ่งได้ให้ข้อมูลต้นกำเนิดของธงตราหมากรุกไว้ว่า ได้ใช้ในการแข่งขันกีฬาแข่งม้าของชาวอเมริกันที่เข้ามาตั้งรกรากในแถบมิดเวสต์ในยุคแรกๆ ซึ่งหลังจากการแข่งม้าก็จะมีการเลี้ยงอาหารกัน เพื่อให้คนภายในงานได้รู้ว่าอาหารพร้อมแล้ว เพื่อที่จะได้หยุดแข่งแล้วมาทานอาหาร จึงได้นำผ้าปูโต๊ะซึ่งมีลายตารางหมากรุกมาโบกไปมา
อีกหนึ่งสมมุติฐานเชื่อว่า ที่ต้องใช้ธงตารางลายขาวดำ เพราะว่าในการแข่งขันมีผู้คนมากมายเข้ามาร่วมชม ซึ่งถ้าใช้สีพื้นสีเดียวอาจจะดูไม่โดดเด่น เพราะสีของธงจะกลืนไปกับเสื้อผ้าของผู้เข้าชม อีกทั้งในการแข่งก็จะมีฝุ่นตลบ จึงใช้ธงตารางหมากรุกซึ่งมีสีขาวตัดกับสีดำทำให้เห็นได้ชัด เพื่อให้ผู้เข้าแข่งขันทราบถึงการได้ผู้ชนะ
ในปัจจุบันยังมีธงหรือสัญญานไฟที่ใช้สีอื่นๆ ซึ่งแทนความหมายต่างๆระหว่างการแข่งขัน
- สีเขียว สำหรับการปล่อยตัวหรือเริ่มแข่งขัน
- สีเหลือง สำหรับเตือนให้ลดความเร็ว
- สีแดง สำหรับยกเลิกการแข่งขัน
- สีน้ำเงิน สำหรับให้ผู้แข่งขันรายนั้น หลีกทางให้ผู้แข่งขันที่กำลังน็อกรอบแซงไปก่อน
